Хочу вместо Winbond W25Q16BV (не нашел) поставить W25Q32BV.

Видел упоминание в закрытой теме о необходимости записывать в таком случае BIOS 2 раза ...
Просто замена невозможна ?

А что мешает записать дубль? Скопировал, вставил..
И желательно знать, в какой ноут

W25Q16BV=16Mbit
W25Q32BV=32Mbit
распиновка одинакова по сути должно прокатить, только не на оборот, будет резать пополам или откажется шить. А если после прошивки контрольная сумма совпадает то дело в шляпе.

Нет никакой необходимости записывать 2 раза, особенно для SPI Flash.
Для параллельных флеш - да, т.к. надо быть уверенным, что будет считывать только из младших адресов. Если нет уверенности, проще делать клон на весь объем.

В Вашем конкретном случае можно ничего не делать, лишь бы софт программатора не ругался на меньший объем и записал флеш с начала .