Собственно, вопрос. Имеются в наличии две матери SAC-001 с КЗ по питанию APU и вторая деформированная волной, обрыв дорожек с пятаками (после неадекватного геймера). В сети нашёл информацию только на первую ревизию 2013 года (SAA-001) Верен ли этот алгоритм, либо уже что-то поправили за годы обновления ПО?

Все верно!!!

Нет не верно! Связка для sac-001 и далее для всех выше будет такой - APU, flash, syscon, renesas.
На фото вместо сискона указана зачем то озу медиакона. Если сделаете как по фото или уже сделали и запустили получите кирпич! Сискон нахожится прямо под фазами питания маркировка имеет начало COL-***

точно!!! не внимательно фото смотрел!