Старый хаб от аппарата у вас остался? Как бы сата именно туда растет. Осмотрите, не сдули ли мелочевку. Если не сильно напряжно, накатайте родной хаб и на место поставьте.
---------- Добавлено спустя 10 минут: ----------
Помимо хаба дело может быть в прошивке - была как-то тема по асусу, который так же веселился.

Может быть хаб, раз меняли.

И еще один вариант - битый mbr на одном из дисков.
Вы разные комбинации проверяли? Попробуйте парами повставлять - 1-2, 2-3, 1-3
Что будет?

Объединил в одну.

Поэкспериментировал с прошивками,в итоге опытным путём выявил,что проблема имеется только на последней прошивке.Поискал в интернетах и обнаружил,что это почти на всех этих ноутах. Вывод - не ставьте последнюю(209) версию