Не видит LAN, в биосе включено, но сеть не разпознаеться, поменял 88E8040-NNC1, питание VDD - 1,25, VDDO_TTL - 3,3 v

История ноута какая? может там дороги под мостом, али мост сгорел..

История нету - включил утром, не работает, грозы не было

Проверьте ещё
VMAIN_AVLBL
AVDD
LOM_DISABLE#

VMAIN_AVLBL - 3,3в
AVDD - 2,5 в
LOM_DISABLE# - 3,3в

еще кварц рабочий

Тогда это странно.
Вы уверены что ваша подмена 88E8040 рабочая?
Как вариант проверить ещё тактирование pci шины для LAN - CLK_PCIE_LAN 55 лапа, если сеть померла при загадочных обстоятельствах то почему бы при таких обстоятельствах и клокеру не подгореть слегка :)
А так если и такт есть и 88E8040 живая, то остаётся только хаб =/

Я же правильно понял вопрос - в системе сетевая карта вообще не определяется?

в системе сетевая карта вообще не определяется

тактирование на 55 лапе - на моем осцилографе показывает около 100 мгц - это норма?

88E8040 - рабочая новая

Пробуйте другой южный мост подбросить.

Заменил мост - сеть повилась.