Сабж выполняет операции чтения памяти со скоростью 102 Мбит/сек при работе от БП и 600 Мбит/сек при работе от аккумулятора. Ключи Q503, Q515 исправны, напряжение при работе от БП не просаживается. ШИМ bq24703, мультиконтроллер, южный мост, клокер - заменёны. Частота кварца клокера - номинальная. Что ещё может тормозить бук?

БП родной? Если не ошибаюсь, там на третьем проводе должно быть около +15в. и в буке через резистор на LMxxx. Если напруга не та на ключах зарядки, будет тормозить.

БП родной и исправный, да и лабораторный БП подключал

Ошибаешся - разъём двухпиновый, компараторы в схеме есть - работают адекватно, ключи исправны.
Что ещё может быть?

Проц другой не пробовали? Bios перешить неплохо бы.

И проц другой, и биос шился, и с клокера тактовая частота проца и памяти - номинал

Бук поднят - причиной оказался заводской брак. Не припаян один вывод резистора в схеме контроля потребляемого тока при питании от сети. Скорость при чтении памяти - 1042 Мбайт/сек.