менял термопасту на ноуте (Toshiba Satellite L500 1wp). После загрузки ОС, спустя какое-то время, экран гаснет и начинает периодически мигать разными цветами (красный, зеленый и т.д.). Может при сборке провод какой пережал? В чем может быть причина?

и еще заметна такая тенденция, что наблюдаемый эффект начинается видимо от температуры проца или видеокарты. То есть, если выключить его, когда начинается это мигание, и тут же включить, то вновь это мигание может начатся еще до того пока ОС полностью загрузится.
Походу че то напортачил я...
Вообще подобный эффект может наблюдаться из-за повреждения чипа видеокарты?

может поробуйте отреболить

Весь экран одним цветом засвечен?
Больше похоже на внутренний тест матрицы.
А на внешний монитор что?

Отсутствовал контакт между радиатором и чипом видео. Сложно вообще найти термопрокладки для конкретной модели ноутбука? И идут ли они в комплекте с системой охлаждения?

Можно найти с другого ноутбука, можно найти в дохлых CD/DVD приводах, можно изготовить металлическую прокладку (медь, алюминий) нужной толщины. На форуме кто то делал из сплава Розе между двумя площадками из фольги.