Доброго времени суток. Поступил данный аппарат, было КЗ и по 3 и по 5 вольтам. Заменены, шим питания по 3 вольтам pu401 (SY8206B), мульт ue1 (it8586e), u2 (AP2820C), сетевая ul1 (RTL8111G) и шим питания процессора pu 901 (ISL62771h), после чего кз пропало. Подключаю питания 3 и 5 вольта поднимаются, реакция на нажатие кнопки есть, не поднимается питание процессора, подскажите в какую сторону копать.

PS биос шил, а вот сам мульт прошить не могу, говорит мультиконтроллер не отвечает, может ли в нем быть проблема?

Может. Без начальной инициализации VCore не поднимется.

Мульт заменил, стал прошиваться, но ситуация не изменилась. Есть идет куда смотреть?

Обычным путем:
ресеты, вычитывание BIOS, ВСЕ вторичные напряжения.