При включении, долго висит на логотипе ASUS. около 1 минуты. Затем загружается и работает всё как надо. BIOS перешивался, такое поведение также при снятом винте и приводе DVD. Не залитый. Может кто сталкивался с этим ?

Попробуйте подкинуть другую флешку Bios. (память, проц надеюсь уже пробовали).
P.S. Шили программатором ?

Проц, память не при делах. Проверил все напруги осциллографон на предмет просадки, фона - всё чисто. шил программатором. Сейчас обнаружил, что он по LAN не видит сеть - возможно проблема в сетевом контроллере. Позжее отпишусь.
---------- Добавлено спустя 1 час 32 минуты 4 секунды: ----------
Да, с контроллером LAN лоханулся, просто дрова не стояли, в общем, проблема осталась ...

Что то садит шину. Проверяйте smbus на просадку. Какая то периферия(сеть,звук,вебка) прижимает дату и все "стоят" в ожидании продолжения обмена данными

Отключил в BIOS Legacy USB support, висеть перестал. Но большинство флэшек подключаются как по USB 1.0 а внешние USB винты вообще не определяются. И сетевую карту перестал видеть. CLK_PCIE_LAN размахом около 0,7 вольт. Предполагаю, что всё-же "сдулся" южник.

Юг+север, читайте до конца viewtopic.php?f=40&t=18936&p=252608#p252608

У меня при таких висяках была камера. Скидываем LVDS, подключаем внешку и проверяем.