Плата поступила нерабочей, предыстория неизвестна. Делалась в свободное время...
Был типовый прогар разъема шлейфа матрицы по контактам 19В.
Также нерабочими оказались несколько ШИМ по основным питаниям: дежурка, 1,05В, 1,35В, 1,24В, 1,8В, а также LAN и ключ питания USB.

Сейчас плата запускается и все исправно работает, НО во время работы ОС с жесткого диска жудкие тормоза, винт постоянно загружен почти на 100% даже в простое. С флешки ОС работает нормально. Отклонения по питаниям не заметил.
Пробовал разные жесткие и разные ОС, подкидывал мульт и инженерные БИОСы, кварцы тоже.

Не хочется грешить на проц N3060. На что еще стоит обратить внимание?

Режим работы контроллера IDE SATA или AHCI SATA.

В БИОСе выбор есть только режима ACHI

Посмотрите в диспетчере задач, какой процесс загружает винт? Свежеустановленная десятка при подключении к интернету долгое время еще шуршит винтом, это нормально.

А в диспетчере устройств под Windows что установлено? Как править реестр для включения AHCI найдете в Интернете.

Какого включения AHCI, если других режимов нет на этой платформе?

SSD пробовали ставить?
https://forum.ykt.ru/viewtopic.jsp?id=4329641
http://cs5-1.4pda.to/11978718.png
Сравните со своими HDD...