Ноутбук выключился и больше не включился, был пробит транзистор PU4808, после замены плата стартует но находится в циклическом ребуте. После прошивки BIOS с грязным ME регионом плата начинает стартовать, но если зашить дамп с чистым ME то поведение становится как и с родной прошивкой (ребут).

Это транзистор верхнего плеча. Пробит, логически понятно, питание 19V пошло по цепи питания 1D05V. А это не есть хорошо, скорее печально. От 1D05V питается напрямую, без свитчей, CPU 1.05V и не только, там и контроллер памяти в нем и GPU, и т.д. и т.п. 99% умер CPU.

В тот то и дело что если CPU умер то как то избирательно, а именно не прошивается ME регион. С кривым ME всё ок, не выключается, частоты нормальные, порты работают, видео работает, обновление BIOS тоже успешно проходит.

Скорее всего Вы мало сталкивались с поломками CPU Intel. У платформы интел, есть такая "характерная черта", если процессор не инициализировался (не вычиталось CPU ID), будет непрерывный reboot (разницы нет, это ноутбук или десктоп) пока не прочтет этот CPU ID.
Вот и у вас все логически понятно, с грязным ME, дело не доходит до инициализации CPU и нет ребута, когда зашиваете правильный биос, проявляется то, что и должно быть, когда нет отзыва CPU... И никакой магии.