- склеиваем 2 файла бэкапа в единый по принципу 8Мб + 4Мб (8 в начале, 4 - конец). О порядке склейки нам говорят начала и концы файлов. Получаем полную прошивку.
- открываем полученный файл 12Мб в любой программе, умеющей с ним работать (fitc, UEFITool, или еще какой - без разницы).
Смотрим карту расположения регионов и их размер, версию ME. Можно извлечь ME и bios регионы для удобства поиска.
- открываем E6540A21.exe в Phoenixtool. На выходе - E6540A21 без расширения, 16 Мбайт.
- открываем полученный файл в HEX редакторе и сохраненные ранее ME и bios регионы старого файла.

Начнем с bios region. Переходим в HEX на него, выделяем и копируем первые 2 строки. Переходим на начало апдейта и ищем (HEX значение) первое вхождение этой последовательности. Здесь оно начинается с 058h. Вот от начала и до этого адреса выделяем и удаляем. Получили начало, как в сохраненном bios region.
Теперь от начала выделяем, вырезаем, вставляем в новый файл 0600000h байт (по размеру bios region). Сохраняем его, например - bios_new.bin. Готово.
Для подстраховки смотрим, правильный ли размер получился и визуально - похож ли конец нового файла на свой образец.
Иногда, зная размер bios region, проще искать по последней строке или ее части, т.к. такое значение попадается только одно. А потом смотрим, где у нашего файла начало от начала апдейта.

ME регион. Все так же. Поиск первой строки сохраненного файла в оставшейся части апдейта. Здесь он начинается, после предыдущих манипуляций, с 08EF24h. Все, что до - удалить. Выделяем от начала, копируем, сохраняем в новый файл 05FB000h байт. Новый ME получен.
P.S. в обновлениях Dell может находиться два ME региона, с разными размерами (но, как правило - одной версии), под разные варианты прошивки.
P.S.S. В конце вырезанных по размеру ME может находиться ненужная информация, которая помешает нормальной работе. Об этом могут сказать те же утилиты при проверке файла. Размер нового ME может не соответствовать старому. Если меньше - добить до нужного значением FF (это для ручной сборки, чтоб bios regon лег по своему адресу).

Обновление.
В зависимости от задачи (сменить ME или / и bios регионы), используем или упомянутый инстррументарий, или руками, в HEX редакторе, в соответствии с картой (с какого и по какой адрес занимает нужный нам регион).
После всех манипуляций и проверок опять разрезаем на 8 + 4 и шьем обе флешки сразу.

Если надо сменить только ME, то проще воспользоваться репозиторием и взять ту же самую версию. Тогда и апдейт не надо кромсать.