Мать мертвая. Стоят две флешки,одна на мульт (IT8518 заменен кстати на новый) вторая основная возле чипсета (BD82HM65).На мультовой питание 3.3 есть,обмен мульта с ней есть, а вот на второй где основной биос питания нет совсем. Появилась ли схема на данную платформу,или может кто сталкивался с такой проблемой. Не могу понять откуда питается основной биос.

Не от 3ALW а от 3VS скорее всего. Питание будет после включения ИМХО.
Можно схемы AB6000, AB6400, AB6600 посмотреть по аналогии.

пока не включается нет смысла копать в сторону хаба и его флешки.
или мать всетаки включается но не стартует?
прошить флэшку рядом с мультом.