Внимательно осмотрите проблемный разъем и прочистите контакты, чистой зубной щеткой, например.
ValeDeMare писал(а):
в биосе если вытащить и воткнуть снова мышку она не работает
Bios определяет конфигурацию один раз при каждом включении питания и перезаписывает ее, в основном, при перезагрузке, а с большей долей вероятности - при отключении питания и повторном включении. Поэтому на отключение или подключение устройств при включенном питании никогда нет реакции Bios.
Windows реагирует постоянно, но адекватно только при наличии правильных драйверов устройств, а для некоторых предусмотренно безопасное удаление.
Подключите в проблемный порт мышь при выключенном ноуте, включите питание и проверьте работу мыши под Windows.
ValeDeMare писал(а):
Каким образом контроллер вообще понимает что что-то присутствует в порте?
По изменению потребления тока.