Предыстория мутная у ноута - кто-то чистил, что-то пошло не так..
Были сколоты пара кондеров, сломаны несколько разъемов, пробит хаб, поврежден мульт, прошивки нет.
Все поменял, прошил с офсайта. Все заработало, проходит все тесты, нагрев в норме.

Но есть один косяк - после выключения, что виндой, что с кнопки, второй или третий раз уже не стартует: загорается на секунду индикатор питания на кнопке и гаснет, с ним гаснет индикатор сети, и так в цикле каждые 5 секунд. Больше реакции на кнопку нет, выключить не дает. Помогает только сброс кмос. После снова все заводится и работает, до выключения.

Что может быть неисправно? Не было ли у кого похожих случаев?

А что конкретно вы прошили (микросхему BIOS, мультиконтроллер) и как конкретно вы это сделали (из Windows или программатором)?

Здесь ответ очевиден - микросхему, программатором. Мульт подтягивает свою сам.
---------- Добавлено спустя 1 час 21 минуту 40 секунд: ----------
Очевиден для тех, кто внимательно читает и думает, а не просто баллы набивает.

Успехов вам в поиске и решении вашей проблемы

Поторопился я про кмос написать - здесь что-то перегревается на плате, и пока оно холодное, можно и 3-5 раз включить/выключить. Чем больше плата нагрета, тем дольше период невключения. Пробовал и греть и охлаждать отдельные зоны на плате - точно найти не могу, но похоже что-то между мультом и питанием видео.

В цикле невключения мульт держит постоянно 5V, поднимает S5_ON, за ним следуют 3V, 1,05V, 1,8V, снимается RSMRST#, DNBSWON# активен, но слипы не поднимаются, и индикатор сети не загорается, и так по кругу. HWPG здесь еще быть не должен, до SUSON дело не доходит. Думал, что может мешать какой-то из Thermal-сигналов, но они вроде все после MAINON должны быть.
Заодно, еще раз поменял мульт, прошил вручную - ничего не изменилось.

Что может тормозить запуск на этом месте?

Плата полежала две недели без питания, и вообще перестала запускаться, уходит в цикл после нажатия кнопки.
Значит, и не нагрев...

Внимательно осмотреть на предмет окислов и непропаев элементов, ну и ёмкости на соответствие параметров, а так же на механику не мешает проверить.