Со слов клиента после грозы перестали работать USB мышь и клавиатура. Оказалось что все USB порты передние и задние не работают. Питание +5V имеется, сопротивление D+, D- относительно земли растет от 0,05KOm до 2,5KOm. Южник особо не греется, драйвера Intel 6 Series/C200 в Windows устанавливаются, но USB устройства не определяются. Флэшка установленная в любой USB порт начинает сильно греться через несколько минут. Визуально на материнке все целое.

Взял похожую мать P8H61-M LX2 там сопротивление D+,D- на землю стабильно 5,5MOm

Где искать? D+ и D- идут прямо в южный мост, или нет? Если бы выгорел южник, плата бы не стартовала, а тем более драйвера на USB контроллер не устанавливались.

Южники по-разному горят- и материнка стартует, и дрова ставятся. греются флешки- явно перегруз

Можно попробовать выжечь юсб, подать с компьютерного блока питания 3.3 вольта сначала на D+ а потом на D-. Если все получится - воткнуть внешний контроллер юсб. Но при этом, может мост выгореть нафиг. Мать и так потенциальный труп, попробовать стоит.

Многовато будет. Из личного опыта прозвонки USB обычно 500 - 800 Ом. Но никак не МегаОм.

Кому-то пора научиться ставить цешку на диоды.Пусть там и попугаи, но но они хоть что-то скажут.
На линиях могут стоять защитные диодные сборки - про них не забывайте.

Что то как то непонятно с замерами .У меня на всех портах по 1.9 Ком

Соглашусь. Только почему попугаи, по-моему милливольты, точнее падение напряжения в них.

Вот как раз в районе 400-500 мВ и должно быть.